El Instituto cuenta con una zona de recepción con dos puestos para la atención al cliente, y dos salas de espera, una para adultos y otra infantil. Existe un elevador para personas discapacitadas que facilita el acceso a las consultas.

La atención médica se lleva a cabo en 3 consultas equipadas cada una de ellas con una unidad de exploración oftalmológica, además de una sala para tratamiento con distintos tipos de láser y otra para la realización de campimetrías, topografía corneal, paquimetría corneal y ecografía-biometría oftálmica.

En el quirófano, dotado con la correspondiente zona de esterilización y antequirófano, se lleva a cabo la cirugía menor así como las inyecciones intravítreas.